有没有什么办法能让mod单独生成在另一个主世界

您可以尝试https://www.mcmod.cn/class/1397.html
不过，鉴于维度本身的界限非常模糊，包括生物、群系、结构等各种东西，上述模组可能未必能做到完全精确的控制。
不少引入了世界生成的模组没有对您的需求提供支持，因此这可能很困难，但您仍然可以碰碰运气。